为贯彻落实胡锦涛总书记在庆祝清华大学建校100周年大会上讲话精神，充分发挥华南理工大学多学科的技术和人才优势，通过体制机制创新，吸引和集聚国内外创新资源，全方位服务东莞的产业转型升级，实现高水平崛起，建设幸福东莞，2012年6月18日，东莞市人民政府与华南理工大学本着“优势互补、互利互惠”的原则，决定联合共建华南协同创新研究院。2012年12月6日，华南协同创新研究院在东莞松山湖高新技术产业开发区挂牌成立。
　　一、建设目标
　　研究院有效整合“政产学研资介”各方力量，坚持各主体定位清晰，形成优势互补，分工明确、成果共享、风险共担的开放式合作机制，围绕国家重大战略需求、重大科技项目、解决行业关键和共性技术及生产实际中的重大问题，力求在科学研究、技术开发和产业发展上取得重大进展和突破，构建围绕创新链的多部门多系统协同创新体系，推动创新要素全面渗透进经济活动中。争取在“十二五”期间，将华南协同创新研究院建设成为中国第一的典范性协同创新研究院。
　　二、建设思路
　　以重大需求为导向，以研究院为载体，重点围绕生物材料与医疗器械、高端装备制造、高端电子信息、新材料、新能源等东莞重点发展产业领域，大力开展协同创新，吸纳高端人才和高水平科研成果，进行技术开发与集成、中试、放大实验，同时吸引国内外龙头企业共同开展成果的转化和产业化，将研究院建设成集高端人才和高新技术企业的国际一流研发转化平台，成为东莞经济建设和社会发展的主要技术支撑和产业转型升级的发动机，成为科技、金融、产业融合创新发展的重要平台。
　　三、建设内容
　　研究院将重点建设产业应用技术的研发、产出可转化成果的协同创新中心（研发、中试平台）和对成果进行市场前的培育和孵化的前孵化器；同事组建投资管理公司，培育前孵化器育成的科技型小微企业成为高成长性的高新技术企业。同时，以国家“2011计划”和“广东省2011计划”实施为契机，吸引国内外最有实力的研究力量和相关行业最优秀的企业在东莞发展。
　　研究院分二期建设研发平台、中试基地、孵化器、行政办公等设施；到2018年将建设生物材料与医学转化、高端装备制造、高端电子信息等3至5个协同创新中心；研究院固定科研人员规模达到500人左右，流动人员1000人左右，孵化或引进企业30家以上，力争培育上市公司3至5家。